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【顯微課堂】冷凍電子斷層掃描

來源:徠卡顯微系統(tǒng)(上海)貿(mào)易有限公司      分類:工作原理 2025-02-20 17:38:37 83閱讀次數(shù)
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冷凍電子斷層掃描(CryoET)用于分辨細(xì)胞環(huán)境內(nèi)的生物分子,分辨率達(dá)到前所未有的一納米以下。

冷凍電子斷層掃描(CryoET)用于分辨細(xì)胞環(huán)境內(nèi)的生物分子,分辨率達(dá)到前所未有的亞納米級,為研究分子社會學(xué)開啟了一扇窗。在這一尺度下,僅通過形狀就可以識別各個蛋白質(zhì),而不需要任何標(biāo)記。但是,亞納米分辨率下的成像伴隨著一個重大的挑戰(zhàn):您需要找到并精準(zhǔn)定位感興趣的部位。


提供先進(jìn)的冷凍電子斷層掃描解決方案,使用冷凍光學(xué)顯微鏡進(jìn)行快速、高分辨率的成像和精確的圖像數(shù)據(jù)傳輸,同時在整個工作流程中保持最佳的冷凍條件。


什么是冷凍電子斷層掃描?

使用冷凍電子斷層掃描(也稱為電子斷層掃描),可以在原生和功能狀態(tài)下以三維分子分辨率分析蛋白質(zhì)間相互作用。樣本在一系列受控的位置上傾斜時,會成像為一系列的二維圖像。由此產(chǎn)生的圖像“切片”可以組合起來,生成樣本的三維重建圖像。

樣本的大小以及適用的觀察技術(shù)。


CryoET工作流程包含哪些步驟?

該技術(shù)涉及樣本的制備,樣本在電子顯微鏡載網(wǎng)上,然后迅速陷入液氮中冷凍,使樣本玻璃化,防止冰晶形成。


為了進(jìn)行高分辨率的冷凍斷層掃描,成像的標(biāo)本切片厚度不應(yīng)大于300納米。為了觀察樣本的“較厚”部分(如細(xì)胞體),必須將樣本減薄。除了冷凍超薄切片技術(shù)外,使用專門或多模態(tài)的冷凍掃描電子顯微鏡進(jìn)行聚焦離子束(FIB)研磨是一種首選方法。兩個離子束窗口的定位應(yīng)確保在感興趣區(qū)域內(nèi)形成厚度大約200納米的薄冰片(薄片),以便進(jìn)行冷凍電鏡電子斷層掃描。


現(xiàn)在可以用冷凍透射電子顯微鏡掃描制備的樣本,然后必須進(jìn)行數(shù)據(jù)重建過程,將二維圖像重建為單一的三維模型。

Coral Cryo 3D冷凍電子斷層掃描工作流程解決方案


典型的CryoET工作流程中有哪些挑戰(zhàn)?

在典型的CryoET工作流程中,最大挑戰(zhàn)是難以確定包含要成像的細(xì)胞或蛋白質(zhì)的精確感興趣區(qū)域。目標(biāo)定位反復(fù)失敗會導(dǎo)致過程非常耗時,最終浪費(fèi)昂貴的電子顯微鏡(EM)成像時間。工作流程中的另外兩個挑戰(zhàn)包括確保樣本質(zhì)量和冰層厚度始終如一,以及在將樣本傳送到冷凍透射電鏡之前使樣本保持充分玻璃化。

LAS X Coral Cryo:基于插值的三維目標(biāo)定位,在x和y方向?qū)η衅M(jìn)行多層掃描(z-stack)。這些標(biāo)記可在所有相關(guān)窗口中交互式移動。


如何用冷凍光學(xué)顯微鏡克服冷凍電子斷層掃描(CryoET)的挑戰(zhàn)?

冷凍光學(xué)顯微鏡可以在兩個重要方面對CryoET工作流程做出積極貢獻(xiàn)。


首先,光學(xué)顯微鏡有助于評估樣本的質(zhì)量。使用冷凍光學(xué)顯微鏡可以快速了解樣本的冷凍質(zhì)量和冰層厚度,以及樣本的分布是否適合進(jìn)一步處理。徠卡的冷凍解決方案可確保樣本在這些步驟中保持安全和活性。


其次,在提高工作流程效率方面,冷凍光學(xué)顯微鏡的最大潛力是能夠在啟動時間和成本密集型的冷凍電鏡制備工作之前,更加精準(zhǔn)地定位感興趣的結(jié)構(gòu)。徠卡的冷凍光學(xué)顯微鏡解決方案能夠?qū)⒛繕?biāo)結(jié)構(gòu)的圖像和坐標(biāo)輸出到后續(xù)的電鏡步驟,從而顯著縮短電鏡成像時間。

一個完整載網(wǎng)的焦面總覽,有不同的模式來識別載網(wǎng)缺陷、對齊標(biāo)志和目標(biāo)分布。HeLa細(xì)胞由德國海德堡歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室Mahamid團(tuán)隊的Ievgeniia Zagoriy提供。藍(lán)色–Hoechst,細(xì)胞核;綠色–MitoTracker Green,線粒體;紅色–Crimson熒光珠和Bodipy,脂滴。一個載網(wǎng)方格的邊緣長度:90微米,比例尺寬度:35微米。完整載網(wǎng)直徑:3毫米


Coral Cryo簡介:迄今更有效的CryoET工作流程

徠卡提供專用的三維冷凍電子斷層掃描工作流程解決方案,可確保樣本活性、進(jìn)行質(zhì)量檢查,最重要的是確保三維目標(biāo)定位機(jī)制精準(zhǔn)可靠,從而克服各種典型的挑戰(zhàn)。我們優(yōu)化的硬件(包含冷凍臺和傳送梭)配合先進(jìn)的CryoET目標(biāo)定位軟件,以及適用于冷凍聚焦離子束(FIB)或真空冷凍傳送(VCT)載物臺的各種無縫集成和傳送選項(xiàng)。

萊茵衣藻,兩種不同類型的鞭毛內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白IFT-NeonGreen和IFT-mCherry。樣本由德國德累斯頓馬克斯-普朗克分子細(xì)胞生物學(xué)與遺傳學(xué)研究所的Pigino實(shí)驗(yàn)室提供。


實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的三維體目標(biāo)定位

了解無縫銜接的冷凍電子斷層掃描工作流程Coral Cryo如何使用共聚焦超分辨率更精準(zhǔn)定位您感興趣的結(jié)構(gòu)。該工作流程可減少并優(yōu)化工作流程的步驟,改善樣本的裝載和傳送,因此可提高CryoET工作流程的效率。


頂部掃描電鏡視圖(左圖)和聚焦離子束視圖(右圖)的超分辨率三維共聚焦疊加圖像。疊加是使用熒光珠作為相關(guān)性標(biāo)志來執(zhí)行的。HeLa細(xì)胞標(biāo)記如下:細(xì)胞核由Hoechst標(biāo)記,藍(lán)色;線粒體由MitoTracker Green標(biāo)記,綠色;脂滴由Bodipy和Crimson熒光珠標(biāo)記,紅色)。比例尺:20微米。細(xì)胞由德國海德堡歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室Mahamid團(tuán)隊的Ievgeniia Zagoriy提供,掃描電鏡/聚焦離子束圖像由該團(tuán)隊的Herman Fung提供。

掃描電鏡的疊加共聚焦三維圖像

掃描電鏡的疊加共聚焦三維圖像(包含聚焦離子束視圖)


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的歷史最早可追溯到19世紀(jì),作為德國著名的光學(xué)制造企業(yè),徠卡顯微成像系統(tǒng)擁有170余年顯微鏡生產(chǎn)歷史,逐步發(fā)展成為顯微成像系統(tǒng)行業(yè)的領(lǐng)先的廠商之一。徠卡顯微成像系統(tǒng)一貫注重產(chǎn)品研發(fā)和最新技術(shù)應(yīng)用,并保證產(chǎn)品質(zhì)量一直走在顯微鏡制造行業(yè)的前列。


始終與科學(xué)界保持密切聯(lián)系,不斷推出為客戶度身定制的顯微解決方案。徠卡顯微成像系統(tǒng)主要分為三個業(yè)務(wù)部門:生命科學(xué)與研究顯微、工業(yè)顯微與手術(shù)顯微部門。徠卡在歐洲、亞洲與北美有7大產(chǎn)品研發(fā)中心與6大生產(chǎn)基地,在二十多個國家設(shè)有銷售及服務(wù)分支機(jī)構(gòu),總部位于德國維茲拉(Wetzlar)。

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